Сюжет

Фильм начинается с того, что Итан Хант (Том Круз) слушает засекреченное сообщение от Эрики Слоун (Анджела Бассет), которая теперь стала президентом США.

Габриэль (Эсай Моралес) и Сущность всё ещё на свободе. Сущность успела заразить киберпространство, подменить данные и столкнуть человечество лбами. Более того, вокруг неё возник целый апокалиптический культ. Единственный способ остановить Сущность — найти её исходный код и соединить его с распятием-ключом, который Итан сумел вырвать из рук Габриэля. Но Итан боится: если правительство заполучит Сущность, оно обратит её в оружие против других стран. Слоун предупреждает, что уничтожение Сущности полностью сотрёт киберпространство и ввергнет мир в новую войну. Она умоляет Итана сдаться — перед тем как сообщение самоуничтожается.

Итан воссоединяется с Бенджи (Саймон Пегг) и Лютером (Винг Реймс), а затем отправляется в австрийскую тюрьму вытащить бывшую напарницу Габриэля — Париж (Пом Клементьефф). Её конвоируют агенты Джаспер Бриггс (Ши Уигэм) и Тео Дегас (Грег Тарзан Дэвис), но Итан и Бенджи успевают внедриться и убедить агентов отпустить Париж ради спасения мира.

В Лондоне, в посольстве США, двое агентов готовы схватить Итана, но тут появляется Грейс (Хэйли Этвелл). Она ловко обчищает их карманы и освобождает Итана, сказав, что её прислал Киттридж (Генри Черни). Но внезапно появляются люди Габриэля и усыпляют агентов.

Очнувшись связанными, Итан и Грейс встречают самого Габриэля. Он напоминает Итану о «Кроличьей лапке» (третья часть), которая якобы была прототипом Сущности, и намекает, что сам Итан отдал её в руки правительства. Но теперь Сущность отвернулась от Габриэля из-за его прошлой неудачи. Он требует от Итана достать «Кроличью лапку» с затонувшей подлодки Севастополь. Итан отвечает демонстративно — кусает капсулу с цианидом. Габриэлю приходится приказать своим людям спасти его. Очнувшись, Итан расправляется с головорезами, освобождает Грейс, и они бегут.

На бегу они встречают Бенджи, Париж и Дегаса. Итан проникает в громоздкое устройство, через которое Габриэль связывается с Сущностью, и подключается сам. Искусственный интеллект знает, что Итан хочет уничтожить его «Ядом» — программой Лютера, которая должна соединиться с ядром Сущности, «Подковой». Сущность показывает Итану видения ядерной войны и предлагает отнести её в Хранилище Судного дня в Южной Африке, где она сможет выжить.

Итан решает разделиться с командой. Он спешит к Лютеру, понимая, что именно он — цель Габриэля. Лютер оказался в подземке с бомбой и украденным «Ядом». Взрыв способен уничтожить весь город. Лютер успевает ограничить радиус поражения. Перед финальным бегом Итана они обмениваются последними словами. Взрыв забирает Лютера, а на улице Джаспер перехватывает Итана. Тот сдаёт себя и ключ.

В самолёте по пути в США Итан раскрывает, что знает истинную личность Джаспера: он Джим Фелпс-младший, сын предателя-ментора Итана из первой части. Итан понимает, что Сущность хочет столкнуть их лбами, и Джаспер намекает, что когда всё закончится, они разберутся между собой.

Киттридж докладывает: Сущность уже лезет в ядерные арсеналы. Остались считаные базы, которые ещё защищены. На встрече с Советом начальников штабов (включая генерала Сидни — Ник Офферман) Слоун требует, чтобы Итан помог им подчинить Сущность. Но Итан убеждён — ни один человек не должен владеть таким оружием. Он получает согласие действовать в одиночку.

В северной части Тихого океана Итан встречает адмирала Нили (Ханна Уоддингем) и вручает конверт с датой «22 мая 1996 года». Это напоминание о погибших коллегах, и адмирал соглашается помочь.

На острове Святого Матфея Бенджи, Грейс, Париж и Дегас находят Вильяма Донло (Рольф Саксон) — того самого оператора из ЦРУ, которого после первой миссии Итана сослали в Арктику. Он живёт с женой Таписой (Люси Тулугарьюк). Донло знает координаты Севастополя, но в дом уже вломились русские наёмники. В перестрелке дом сгорает, но команда спасает супругов.

Итан ныряет в Берингово море вместе с экипажем капитана Бледсо (Трамелл Тиллман). Но один из бойцов, Хагар, оказывается адептом Сущности и пытается убить Итана. Спасает его напарница Кодиак (Кэти О’Брайан).

Добравшись до подлодки, Итан находит тела экипажа и «Подкову». Но субмарина начинает погружаться в разлом. Он чудом выбирается, но теряет дыхание и почти тонет подо льдом. Его вытаскивает Грейс.

В камере декомпрессии Итан извиняется перед Донло за то, что тот оказался в Арктике из-за него. Донло отвечает: «Если бы не это, я бы не встретил Тапису». Команда обсуждает план: загрузить Сущность на физический носитель, соединяя «Яд» и «Подкову» в идеально рассчитанный момент. Эту миссию Итан доверяет Грейс.

В США Слоун решает: лучше самой обнулить ядерный арсенал, чем позволить Сущности захватить его. Попытка переворота среди её окружения проваливается — генерал Сидни жертвует собой и убивает предателя.

Команда пробирается в Хранилище Судного дня. Там уже ждут Габриэль, Джаспер и Киттридж. В центре — ядерная бомба с таймером на 20 минут. Начинается перестрелка. Габриэль уносит «Яд». Итан бросается за ним, пока Бенджи, Париж и Грейс лезут в серверную. Бенджи получает пулю, Париж экстренно его оперирует и параллельно направляет Грейс. Донло, Таписа и Дегас пытаются обезвредить бомбу.

Габриэль улетает на биплане. Итан цепляется за другой самолёт, устраивая воздушную погоню. В финале он выбивает у Габриэля «Яд», а тот, смеясь, отпускает ремень, уверенный в своём парашюте. Но судьба шутит: он ударяется головой о руль и летит вниз. Итан соединяет «Яд» и «Подкову», а Грейс завершает загрузку. Сущность поймана. Бомбу обезвреживают в последнюю секунду.

Итан чудом спасается запасным парашютом. «Яд» проигрывает ему послание Лютера с клятвой МВФ: «Мы живём и умираем в тени — ради тех, кого любим, и ради тех, кого никогда не встретим». Это — прощание.

Киттридж злится, видя сожжённую «Подкову». Джаспер же, напротив, отпускает прошлое и уходит с миром.

В Лондоне команда встречается в последний раз. Грейс передаёт Итану Сущность в виде накопителя. Он обменивается взглядами с Бенджи, Париж и Грейс — и они расходятся в тени, туда, где их место.